capybara でサブドメインを利用したアプリのテストをするには

capybara のドライバによって設定の仕方は違うようですが、デフォルトの Rack::Test であれば

Capybara.default_host = "en.example.com"

のようにすることで、サブドメインへアクセスすることができるようになります。

参考

capybara with subdomains ― Gist